Présentation

Le Cati CODEX (COnnaissance et Données EXpérimentales)  fédère un ensemble de compétences coordonnées et homogènes en calcul scientifique et en informatique afin de proposer une approche intégrée du traitement des données expérimentales, en alliant des savoir-faire relevant de la gestion de données, de la représentation des connaissances et des statistiques.

Le Cati CODEX construit une offre (méthodes et outils logiciels) pour permettre le traitement complet de la donnée, de l'acquisition à l'analyse, en soutien aux recherches mobilisant des données expérimentales dynamiques multi-échelles (phénotypage haut débit plantes-levures, filière vigne).

Responsables : Nadine Hilgert et Pascal Neveu

Le Cati est rattaché au département MIA. Il est composé de membres issus des départements: EA, SPE, GAP, CEPIA, AlimH, MICA.

CODEX s’organise en 3 axes qui interagissent :

• Axe 1: Infrastructures pour le traitement de données haut débit : cet axe vise les ressources pour le stockage, la sécurisation, la conservation, la distribution et le transfert d'informations numériques ainsi que les ressources pour le "calcul" (CPU,GPU) et leur accès (protocoles, architectures, etc). L'objectif de l'axe est de travailler sur les méthodes pour la mise en œuvre de ces ressources (Animateurs Patrick Moreau et Vincent Nègre).

• Axe 2: Système d’Information de données et connaissances : cet axe concerne la production de modèles de données (base de données relationnelle, XML) ainsi que la représentation de connaissances (graphe sémantique, ontologie, etc.). L'axe comprend également le développement de logiciels avec un savoir faire autour de la mutualisation et de la diffusion  (Animateurs Anne Tireau et Jonathan Mineau).

• Axe 3: Statistique-mathématique pour les données complexes : Cet axe comprend l'analyse de données et en particulier la statistique pour données fonctionnelles (étude de courbes). L'axe intègre également l'analyse et l'interprétation d'images, de spectres ou d'empreintes métaboliques au cours du temps (Animateurs Nadine Hilgert et Eric Latrille).

Les animateurs d'axes sont chargés de favoriser les interactions, la valorisation et la bonne diffusion au sein des communautés.

Le fonctionnement du CATI est organisé autour :

• d'un bureau composé des 2 responsables ainsi que des animateurs des axes;
• d'un comité de pilotage et de suivi.